Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms