Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNED1Q8TER0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNED1Q8TER0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms