Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms