Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC9Q8NEP7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC9Q8NEP7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms