Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms