Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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