Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G2

VGLL2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL2Q8N8G2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL2Q8N8G2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL2Q8N8G2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms