Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X6

LCORL, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORLQ8N3X6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORLQ8N3X6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORLQ8N3X6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORLQ8N3X6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms