Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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