Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms