Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3FQ6ZSY5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms