Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms