Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC141Q6ZP82 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms