Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms