Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms