Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPPQ6IPU0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms