Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms