Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms