Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms