Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC18Q5T9S5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms