Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PERM1Q5SV97 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PERM1Q5SV97 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms