Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms