Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIPR1Q53HC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms