Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms