Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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