Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LETM2Q2VYF4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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