Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf58Q2M2W7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C17orf58Q2M2W7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms