Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM187BQ17R55 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms