Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms