Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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