Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ECM1Q16610 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECM1Q16610 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECM1Q16610 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM1Q16610 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
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