Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms