Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms