Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF2Q15853 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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