Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNA2Q15822 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA2Q15822 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
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