Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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