Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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