Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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