Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYTH1Q15438 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms