Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 UBE2I-219ENST00000568989 498 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 31.9
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SF3B4Q15427 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 31.8
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SF3B4Q15427 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 ACADS-203ENST00000539690 1142 ntTSL 214.58□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 ZNF316-202ENST00000427912 520 ntTSL 313.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.17□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 RHEB-206ENST00000482053 557 ntTSL 33.37□□□□□ -1.874e-13■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CHD2-203ENST00000625243 361 ntTSL 1 (best)2.87□□□□□ -1.952e-11■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 USP19-211ENST00000479073 360 ntTSL 512.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.987e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 31.8
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SF3B4Q15427 MCRS1-208ENST00000548646 608 ntTSL 314.75□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 MCRS1-204ENST00000547182 724 ntTSL 314.75□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CDC6-204ENST00000580824 696 ntTSL 313.95□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 ROR2-208ENST00000550066 4360 ntTSL 29.69□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 CDC6-205ENST00000582402 353 ntTSL 33.91□□□□□ -1.787e-7■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 210.04□□□□□ -0.86e-9■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 TRMT2A-215ENST00000487378 654 ntTSL 213.55□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 313.34□□□□□ -0.279e-8■■■■■ 31.8
SF3B4Q15427 FASTK-207ENST00000466855 1894 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 31.8
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