Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RYR3Q15413 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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