Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3CQ15386 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms