Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms