Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms