Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms