Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
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