Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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