Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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