Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPSQ13938 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms