Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms